辨證論治是中醫學的又一個基本特點，是中醫學在認識疾病和治療疾病中有別于其它醫學的顯著特征，是中醫學獨有的一種臨床診療體系。
要講清楚辨證論治，我們必須從“辨”和“證”兩個字開始談起。不是學中醫的，一般會認為這兩個字運用不當，大家熟悉辯證法，辯證地看待問題，用的就是“辯”而不是“辨”。談起病癥用的是“癥”而不是“證”。從文字學的角度來看，“辨”是辨別，分辨的意思，而“辯”是辯解，辯論的意思，由此可見，中醫學時的辨證診治就不能用“辯證”論治。
中醫的“證”是指人體在疾病發展過程中某一階段的全方位的概括，它包括了疾病的部位、原因、性質，以及人體正邪關系的最本質的反映，是疾病的“證候”，比癥狀的“癥”更深刻、更全面、更準確的揭示疾病的本質，是在望聞問切基礎上辨證所得的結果，而不是疾病所表現出一個又一個的癥狀。從文字學上，“證”與“癥”可以通用，但在中醫學里絕不能把“辨證論治”寫成“辨癥論治”。中醫學里“證”與“病”也不同，因為中醫認為“一病總有數癥”，也就是說中醫是通過“辨證”來“辨病”，“辨病”之后再進一步“辨證”，通過望聞問切將采集到的個體特征、癥狀，通過分析與綜合，辨清疾病的證候，在此基礎上“論治”，就是根據辨證的結果，確定相應的診療方案。這個過程就是“辨證論治”。
舉一個例子，有人初起發熱、頭痛、鼻塞，就醫時醫生通過以上癥狀初步進行辨證，得出結論為感冒病。但同樣是感冒，每個患者癥狀又不同，有人流濃鼻涕，有人流清鼻涕；有人發熱，有人不發熱，等等。這個時候中醫就需要進一步辨證，中醫認為感冒分為風熱感冒和風寒感冒兩種不同的證，只有把感冒所表現出“證”是屬于風寒證還是風熱證辨別清楚，才能確定用辛溫解表還是用辛涼解表的方法來治療。同是感冒病，但如果是風寒證，而用了辛涼解表藥，病情不僅沒有控制，反而會加重；如果是風熱證，用了辛溫解表藥，效果也會反之。只有正確的辨證，才能得出正確的治法和開出有效的方藥。這也說明中醫是辨證論治而不是辨病診治的道理。
辨證論治反映了中醫治病不是頭痛醫頭，腳痛醫腳的局部對癥治療，也不是不分主次、不分階段、一藥對一病的治病方法，而是辨清疾病的發生的原因、發展的過程、以及在個體體質正邪關系的基礎上綜合分析的診療結果。在辨證論治思想的指導下，中醫治病不僅重視“病”的異同，也重視“病機”的區別，這就產生了同樣是感冒，發病的季節不同，治法也不一樣，夏季感冒多以感受暑濕邪氣，因此治療常用芳香化濁的藥物以祛暑濕。
總之，中醫在診療過程中重視患者自覺癥狀以及望聞問切合參，分析綜合，認識疾病的本質，為臨床診療提供確切的依據，這就是辨證論治。
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